容器苗生产的优点是移栽时候不需要大量断根，但它也有缺点。如果一棵树木在容器里面生长时间过长，其根系因为不能往外伸展，很容易便长出“盘根现象”，造成种后倒伏。由此可见，容器苗只有很短的“货架寿命”(shelf life)，必须在根系长满之时进行移栽，以免产出“盘根现象”。所以育苗容器的选择很重要。
容器的尺寸、材质、颜色、牢固度、使用期、形状、排水透气性等因素都对苗木的生长有影响。
容器的尺寸要根据苗木的生长情况和产品定位来更换，不能过大也不能过小。比如红叶石楠新扦插成活的小苗，一般会选择用12x10或者13x2厘米的营养钵周转。因为这种苗是工程专用苗，所以在营养钵生长到4个月左右，就可以销售了。如果苗子有滞留，营养钵已经不能再继续生长，应换成1加仑盆。容器过大或过小都是浪费，一般苗子可以在合适的容器中过渡一下，等长大合适大小再换盆也不迟。如果用加仑盆栽种苗子的话，一年就要换一次盆，如果是美植袋一类可以控根的容器则可以撑得久一些。
容器的颜色对苗木生长的影响，最主要表现在夏季。如果是黑色容器，在夏天的时候，暴露在太阳光之下的话，其中的介质温度可能会超过48度，而如果是白色容器的话，则可以适当降低介质的温度。不过，白色容器抗紫外线能力比较弱，使用寿命没有黑色容器长。而且白色容器颜色很浅，在介质外围生长的藻类会降低促进根生长的氧气含量。所以，一般还是选择黑色容器比较好。选用黑色容器，夏季遮阴的工作就要做好。
