作为培育苗木的常规场所，苗圃的环境条件是最适合苗木生长的，但在这里生长的苗木最终都是要运送到各个工程地的，且不说这些地方环境条件变化很大，光是在运输途中就容易造成一些苗木活力的丧失。因此，这之间对苗木的保护就显得十分重要。
【装车】
1. 带土球苗木
装卸车时应轻吊轻放，不得损伤苗木和造成散球。起吊带土球小型苗木时，应用绳网兜土球吊起，不得用绳索缚捆根颈起吊;重量超过1吨的大型土球，则应在土球外部套钢丝缆起。
装车时，应按车辆行驶方向，将土球向前、树冠向后码放整齐;花灌木运输时可直立装车。带土球小型花灌木运至施工现场后应排码整齐，若当日不能种植应注意喷水保持土球湿润。
2. 裸根苗木
裸根乔木长途运输时，应覆盖并保持根系湿润。装车时应顺序码放整齐;装车后应将树干捆牢，并应加垫层防止磨损树干。
裸根苗木自起苗开始暴露时间不宜超过6h，当天不能种植的苗木必须进行假植。
3. 容器假植苗木
珍贵树种和非种植季节所需苗木，应在合适的时间起苗，并用容器假植。保证运输及栽植过程不散球、不失水。
卸车时应轻拿轻放，带土球苗木应抱球轻放，不易提拉树干;土球较大的，可用长而厚的木板斜搭于车厢，然后顺势慢滑卸下，不能滚卸，以免散球;裸根苗不宜抽取，更不可整车掀下;对于根系失水的苗木，应先浸水1-2天。
最佳的运输环境是将苗木保持在近似贮藏的温湿度条件下，即温度为0-3℃，空气相对湿度90-95%。不过这样的条件一般只有冷藏车可以满足。
通常在运输过程中，要根据距离的远近选择相应的包装材料，例如，短途运输可以用稻草片、蒲包、化纤编织袋、布袋、麻袋等;长距离运输则要选用保湿性好的材料，如塑料袋、kp袋等。在运输过程中要定时检查，发现苗木干燥时要随时浇水，卡车必须有帆布棚遮挡，严禁苗木受风吹日晒，尤其是针叶树苗更不许未经任何包装，裸根运输。途中休息时，应将车辆停在阴凉处
正常情况下，苗木运到现场后必须及时栽植，但由于各种原因以及一些大批量的工程不可能马上就栽植完，这时候就需要先将苗木采取措施妥善存放。
对于裸根苗临时放置，可用苫布或草袋盖好，干旱多风地区可在栽植地附近挖浅沟，将苗稍斜排于沟内，用土埋根。较长时间的保存，则需进行假植，并保持土壤的湿润，但也不可过湿以免沤根。带土球的苗木倘若能在1-2天内栽完的可不必假植，应集中放好、四周培土，将树冠用绳捆拢好。如囤放时间较长，土球间隙中也应加细土培好。
此外，类似苗木截干、分级、剪根、数量统计等工作都应在苗圃完成，在造林地应尽量减少对苗木不必要的处理，以免影响栽植质量。
